为了给新一轮战役助威，尼米兹于2月4日晚乘B-24型飞机“解放者”号离开珍珠港前往塔拉瓦岛，同斯普鲁恩斯、特纳等人商讨即将开始的进攻埃尼威托克岛的问题。由于埃尼威托克岛离特鲁克岛仅669海里，第58特混舰队（即原第55特混舰队）将分两路支援此次进攻战。1个特混大队在埃尼威托克岛附近进行直接支援，另外3个特混大队前去袭击特鲁克岛。
美军希望对特鲁克岛的威胁，能迫使日军联合舰队出来迎战。
然而，美军未能实现尽早与日联合舰队决战的愿望。山本五十六的继任者古贺峰一对美军的战略意图极为敏感，当他发现美军飞机对特鲁克的侦察行动后，便急令联合舰队撤离特鲁克，向西退至加罗林群岛的帕劳群岛。
2月17日，美军对埃尼威托克发起进攻。经过多日的空中轰炸，到21日，美军占领该岛。
1944年2月中旬埃尼威托克岛被攻占之后，参谋长联席会议立即电召太平洋战区的两员大将尼米兹和麦克阿瑟出席会议。但是，麦克阿瑟借故缺席，这使得诸位高官深感失望和不满。这实际上也使麦克阿瑟丧失了一定的信誉。
3月11日，参谋长联席会议确定了最后的战略方案：批准了4月15日进攻霍兰蒂亚；尼米兹的部队6月15日进攻马里亚纳群岛；9月15日进攻帕劳群岛；11月15日开始支援麦克阿瑟部队进攻棉兰老。
可以说，这一方案带有折衷性质，但基本上符合金和尼米兹的战略构想。
当尼米兹回到珍珠港太平洋舰队总部时，令他惊讶的是，麦克阿瑟的一份电报放在了他的桌上。电文称：“我久有此意，向阁下略尽地主之谊。通过我们之间的私人会晤，我肯定将会大大增进双方司令部的紧密协作。因此，阁下如有时间来布里斯班作客，我将深为高兴，定予热诚欢迎。”
这是一个非同寻常的讯号，它意味着麦克阿瑟将在一定程度上改变长期以来形成的两大军种间矛盾重重的关系。在此之前，尼米兹曾多次试图与麦克阿瑟会晤，但对方始终不断拒绝，而此次麦克阿瑟却主动发出了邀请。尼米兹知道事出有因：麦克阿瑟已经意识到由于自己的傲慢无礼，可能得罪了参谋长联席会议的高级官员，他担心自己的指挥权旁落海军之手。有关指挥权的讨论，一直是华盛顿争论中棘手而敏感的问题。参谋长联席会议最后决定采取审慎行事的态度，对作战指挥的界限维持现状。
尼米兹对麦克阿瑟争夺指挥权的做法当然是不满的。麦克阿瑟此时在雷伊泰海面拥有未投入战斗的舰艇221艘，他这样做完全是出于要控制力量的目的。尼米兹认为这种做法完全没有道理，是一种使任何人都感到愤慨的浪费，他有义务去减少这种浪费。他认识到两个指挥部的协作，将有利于战事的进展，更早地带来和平。因此，尼米兹决定克制心中的怨愤，接受麦克阿瑟的邀请，他说：“对阁下热忱的邀请，我深为感谢。今晨我由华盛顿回来时读到此电，我将以莫大的荣幸在不远的未来获得阁下的款待。我们之间的会晤将使我们在未来战斗中获得最密切的协作。数天内，我将把可能动身的时间奉告给你。”
为了这次会晤，尼米兹做了精心准备：从朋友那里弄到珍贵的兰花品种，打算送给麦克阿瑟夫人；派人到檀香山为小阿瑟买了印有夏威夷文的丝质运动衫，另外还买了几盒糖果。
不到10天，尼米兹就动身了。
3月25日，尼米兹的水上飞机滑行到布里斯班的码头时，麦克阿瑟和他的参谋人员已经在此等候迎接。这多少令尼米兹感到有些惊讶。
尼米兹一行下榻在华丽的伦南斯旅馆一套舒适的房间里，从这个旅馆经过广场就是昆士兰最高法院大楼。
麦克阿瑟的副官向尼米兹呈上当晚在旅馆设宴招待的请柬，尼米兹及其副官拉马尔收下请柬，但坚持要在赴宴前先去麦克阿瑟的住处拜访。
这种外交礼仪是成功的。麦克阿瑟和夫人极为愉快地接受了外岛来的兰花。尼米兹提出要给小阿瑟赠送礼物时，麦克阿瑟说他的儿子已经睡觉了。
“将军，”麦克阿瑟夫人说，她总是这样称呼她的丈夫，“应该把他叫起来一会儿。”
麦克阿瑟有些勉强地把孩子叫了起来，尼米兹把运动衣和一大盒糖果送给他。
第二天举行会议前，美国宪兵在伦南斯旅馆前的街上布置了严密的岗哨。拉马尔看到小阿瑟和他的中国保姆穿过最高法院外的空地，等房门打开他们进去后，门又被锁上。拉马尔听说，孩子和他的保姆每天都要在院子里散步一个小时。
会议在麦克阿瑟的办公室举行，两位将军保持正式礼节，由于彼此心存戒备，难免有距离感。但这种会晤还是有意义的。会晤顺利进行。接待是友好的，有关战备方面的决定是相互谅解的。尼米兹同意对霍兰蒂亚进攻战给予支援，但将分两步进行：4月1日，第58特混舰队的快速航空母舰袭击帕劳群岛及加罗林群岛上的日军基地，然后返回马绍尔群岛补充给养。再于登陆当天驶往霍兰蒂亚加入战斗，但大型航空母舰须在登陆第二天即撤离，而留下8艘小型航空母舰提供近距离空中支援。麦克阿瑟对这一计划表示满意，并许诺将出动轰炸机和P-38远程战斗机袭击附近的日军机场，以保证航空母舰的安全。双方商定，在霍兰蒂亚的登陆日期为4月22日。
当尼米兹即将离去时，参谋长联席会议要求两人共同制定一个抄近路快速向吕宋——台湾——中国大陆三角地带推进的补充作战计划。麦克阿瑟大为恼火，说他不能抛下菲律宾不管，他对菲律宾人民负有神圣的义务，并讥讽说：“呆在华盛顿的先生们不了解情况，从来没有听过枪声，却在那里炮制太平洋战争的战略。”
尼米兹插话说：“我理解你的心情，但我不同意你的看法。参谋长联席会议的成员们同你我一样，都在努力工作，并且想把工作做得更好。从内心讲，他们是值得钦佩的。”
尽管存在意见分歧，但尼米兹对这次会晤还是感到满意的。他在写给金的报告中说：“我和我的下属们在整个访问期间，受到麦克阿瑟真诚而周到的热情款待。接待是没有什么可挑剔的。会议自始至终都开得很好，很顺利。”
尼米兹承认麦克阿瑟是一位杰出的人才，不过这个人喜怒无常，有时突然会表现出与以往迥然不同的气质。那些见过麦克阿瑟的人，有的既赞扬他，又对他有某种说不出的反感。他既才华横溢，又狂妄自大，两者之间常常无法找到折衷、调和的余地。就个人而言，麦克阿瑟并无多少可以使尼米兹把他当作挚友的吸引力，但是尼米兹尊重这位军事领袖的才干。
7打进日本本土
正当太平洋舰队积极筹划和演练马里亚纳作战计划的时候，日本联合舰队统帅人物古贺峰一在美第58特混舰队进攻帕劳群岛时，与其随员以及参谋长一行分乘2架大型水上飞机由帕劳岛起飞，欲飞往菲律宾的达沃，途中遭到暴风雨冲击，参谋长福留繁的座机拼力挣扎，终于在菲律宾的宿务岛附近海面迫降，幸免一死，而古贺的座机却杳无音讯，附近驻防的日机、舰艇全力搜索，结果一无所获。
古贺的参谋长被菲律宾抗日游击队俘获，其随身携带的一箱绝密文件被送交美军。在缴获的文件中，有一份称为“Z行动”的提纲，显然是日本海军的作战计划。该计划最终被送往珍珠港太平洋舰队总部，莱顿和他的日文专家们连夜把文件翻译出来。日本海军把这个作战计划看作是对敌军具有决定性意义的行动，计划作战的地区一直延伸到马里亚纳群岛-加罗林群岛-新几内亚一线。
1944年5月5日，日本广播电台宣布丰田贞次郎大将为联合舰队司令长官。为挽救危局，大本营向丰田大将发布了“阿号作战”命令，企图集中大部分兵力，再次决战，一举歼灭美舰队。此时，珍珠港方面已获悉，“阿号作战”计划只不过是“Z行动”的具体翻版。尼米兹看了“Z行动”的译文后，便下令把文件发给集结在马里亚纳群岛附件的所有舰长。
美军一直期望同日军航空母舰舰队交战，并将其彻底歼灭。现在，这一时刻终于要来临了。尼米兹得知日军舰队中有偷袭珍珠港的“翔鹤”号和“瑞鹤”号航空母舰时，心中顿感振奋。他对史密斯将军说：“有朝一日，当我在办公桌上看到击沉日军这两艘航空母舰的电报时，那就是我一生中最高兴的一天。”
1944年6月，美军向马里亚纳群岛发起了进攻。美军尽管存在不利条件，但尼米兹以及太平洋舰队的领导人对即将来临的决战还是充满了必胜的信心。有新闻记者问：“日本广播电台宣称，‘一场大海战即将开始’，你对此有何看法？”尼米兹回答：“我希望他们讲的是真话。我真不知道怎样才能把他们引出来打一场大仗。”
18日黄昏，美舰队在西南355海里处发现了日本舰队。米切尔建议连夜把舰队开到西面靠近日军舰队的地方，以便在19日凌晨与日舰交战。然而，斯普鲁恩斯在与参谋们讨论了1个小时之后，决定不去迎击日舰队。他向部队下达的命令只提出“攻占并守住塞班岛、提尼安岛和关岛”，而没有提到连续进攻敌军的舰队。
米切尔和他的飞行员为此大失所望，认为斯普鲁恩斯使他们坐失良机，米切尔痛苦地抱怨道：“敌人跑了，它曾一度处于我攻击范围内。”飞行员普遍埋怨“这是非飞行员指挥飞行员带来的结果”。
直到第二次世界大战结束，才证明斯普鲁恩斯的战术是完全正确的。从缴获的日军档案来看，6月19日那天，斯普鲁恩斯凭他的运气或直觉把第58特混舰队部署在最理想的位置上。
马里亚纳海战不失为一场意义重大、战果辉煌的战役，经此一战，美海军掌握了马里亚纳的制海权和制空权，为美军最终战胜日军奠定了良好的基础。
到8月中旬，宽阔的马里亚纳群岛终为美军所有。在攻占塞班、提尼安岛和关岛的战役中，美军死亡5000人，而消灭日军近6万人。美军最终突破了日军最后一道防线，夺得了下一步作战的后勤基地、潜艇基地和将轰炸东京工业设施的B－29型轰炸机基地。
在尼米兹司令部里，那幅太平洋海图上，进攻日本本土的指示箭头正从硫磺岛上划过。
只是由于气候恶劣等原因，尼米兹才不得不将进攻硫磺岛的日期由1945年1月20日推迟到2月19日，进攻冲绳岛则由3月1日推迟到4月1日。
12月10日，英国太平洋舰队司令、海军上将布鲁斯·弗雷泽爵士在澳大利亚的悉尼建立了司令部。紧接着，尼米兹收到从伦敦和悉尼发来的连珠炮似的电报，要求他与弗雷泽上将举行会谈。电报还通知尼米兹，说弗雷泽和他的参谋人员已前往珍珠港。尼米兹对此颇感不适，他写信给金说：“我不需要保罗·里维尔式的紧急通知。这些电报就像是给占领军下达的一道作战命令。也许其用意就是要英国舰队成为一支占领军。”
弗雷泽和他的参谋人员于12月16日抵达珍珠港，尼米兹与他进行了礼节式的会面，并邀请他到寓所作客。两人曾是故旧。10年前，尼米兹在远东任“奥古斯塔”号舰长时，曾同他见过面，当时两人都是上校。
在英美首次会谈中，尼米兹提出了他最关心的问题，即英国舰队在海上的续航力问题。
弗雷泽声称，他的舰队有自己的后勤部队，可以海上加油。他保证他的舰队一个月内可在海上连续航行8天。尼米兹微微一笑，表示不相信。
为了使美国各战区总司令的军阶与盟邦相对应，美国会制定了一项可授予陆军和海军将领为五星上将新军阶的法令。1944年12月19日，授予4位陆军上将和3位海军上将新的军阶。
总统命令授予马歇尔、麦克阿瑟、艾森豪威尔和阿诺德为陆军五星上将，莱希、金和尼米兹为海军五星上将。
尼米兹接受五星上将军衔时，心情十分激动。爱戴他的水兵们专门推举金属专业毕业的战士为他准备了一副新的领章，他们把旧领章上的星摘下来，把五颗星排成了一圈。尼米兹无法掩饰兴奋的心清，他佯装眼花，开玩笑地说：“好大一会，我才看见了星星。”
为了在战区附近建立一个前进指挥部，尼米兹决定将总部移至关岛，向前进驻可使他朝战区推进1000海里，而且可使他摆脱官场的文牍主义气氛。此时，太平洋美军总部的编制和人数大增，他已不可能无拘无束、称心如意地办事。尼米兹宁愿带一个精干的参谋班子，而且尽可能只要那些公认的与作战计划和指挥有关的人员随行。他还希望在个人行动及战争决策上，由自己去承担一些风险。
尼米兹于1945年1月27日抵达关岛新指挥部，斯普鲁恩斯也于同日在乌里锡走马上任。2月2日，尼米兹自关岛总部飞抵乌里锡，登上第5舰队旗舰“印第安纳波利斯”号，与斯普鲁恩斯将军商讨即将开始的硫磺岛战斗。尼米兹所以决定放弃日军重兵防守的台湾，而攻占硫磺岛和冲绳岛，是因为这两岛离日本本土很近，可以作为直捣东京的战斗机、轰炸机的出击基地和紧急降落基地。
硫磺岛是小笠原群岛中硫磺列岛的主岛，位于东京以南700余海里的洋面上。空中侦察表明，这个由熔岩和火山灰烬形成的、整日弥漫雾气和硫磺气体的荒岛是个易守难攻之地。
由于该岛为日军“内防御圈”上关键性的链环，日军在此精心营造了极为坚固的海上堡垒。
霍兰·史密斯将军在研究了空中摄影的照片后，宣称“此处是我们最难攻占的地方”，并忧心忡忡地预计美军要伤亡2万人。
自1944年8月对此岛开始的空中目标袭击并未取得明显成效，日军的防御设施有增无减，已由原来的450处发展到700多处。岛上原有2个机场，现已扩增为3个。显然，日军把防御工事筑到火山熔岩中去了，工事上覆盖的黑色火山灰层减弱了炸弹和炮弹的破坏力。
无论未来的战斗将如何艰巨，攻占该岛的意义已经十分明确，问题在于进攻将怎样实施。斯普鲁恩斯决定用第58特混舰队的飞机摧垮东京地区的航空基地网，以保护硫磺岛外的美国舰只不受日机空袭。这是自1942年4月社利特尔的“东京上空10分钟”行动以来，第一次用航空母舰袭击日本。斯普鲁恩斯计划用两天多的时间来完成这次袭击。快速航空母舰可在乌里锡完成补给，2月16日驶到日本外海。
尼米兹同斯普鲁恩斯商讨之后飞抵塞班岛，视察进攻硫磺岛的部队进行最后一次登陆演练。陆战队有3个师执行这次作战任务：第4师、第5师担负进攻，第3师为后备师。巡视结束后，尼米兹飞返关岛。
