在寒冷的季节里，船队在圣胡利安港停留了将近5个月。这里是一个满目荒凉的地方，林木参天，渺无人迹。船队充分利用这里的树木，锯成木料，制成木板，把破损的船板和桅杆都换上新的。船工们整天不停地紧张工作着，这是朝向新的目标进发的准备，他们相信很快就要起航，期望快离开这凄凉寒冷的荒野，驶向南海富庶的岛屿。
在圣胡利安港停留的前两个月里，在岸上没有见过任何一个土著人。后来，一天早晨，突然在远离岸边的山坡上，出现了一个奇怪而又高大的人，他比常人高一倍。比加费德在日记中写道：
“这个人十分高大，我们只能到他的腰部。体格魁梧，四方脸膛，上面涂着些红道儿，眼睛周围画着黄色眼圈，面颊上有两个心状的斑点。短短的头发涂成白色，衣服是由兽皮缝制成的。”
麦哲伦称他们为巴塔哥尼亚人（大脚民族的意思）。这种人所穿的鞋很特别，把皮子先套在脚上，从膝盖以下直到脚底，定型晾干，再把皮子缝制成软底鞋。一遇雨雪，就在软底鞋外面再套上大皮靴，大概就是这种鞋留在地上的足迹很大，才起名叫“大脚民族”的。
这个身披兽皮的人，面带笑容，和蔼可亲的伸开双手边舞边唱，慢慢地向舰船走来，同时还不断地把沙子撒在自己的头发上。麦哲伦曾多次旅行，对原始民族的习俗早就比较了解，他知道这些举动是表示要相互友好。因此，便吩咐一个水手模仿他跳舞，并把沙子也撒到自己的头发上，野人看了十分欣喜，向他们投以信赖的目光。当水手们把一面铜镜子塞到这个憨厚的巨人面前时，当他第一次从镜子里看到自己的容貌时，竟吓得掉头就跑。这个野人的饭量大得惊人，一顿可以吃完半篮子面包干，一桶水。惊愕的水手们见他饭量过人，觉得新奇，又给他拿来几只大老鼠，他连皮带毛活活地吞而食之，水手们顿时喧嚷起来。
这个野人和水手之间彼此都有好感，麦哲伦又送给他几件小玩具，于是，他高兴得又跑回去招呼来几个巨人，其中还有女的。然而，这种信任却断送了这些自然之子的生命。麦哲伦同哥伦布一样，肩负着把各种不同的植物和矿物标本带回国去，也有把特殊人种带回去的任务。水手们用诡计，设圈套欺骗他们。给两个野人一大堆小巧玲珑的礼物，接着又把一种闪闪发光，铿锵作响的脚镣给野人看，问他们愿不愿意把它戴在脚上，巴塔哥尼亚人却眉开眼笑，频频点头，野人双手捧着礼物，俯下身子，好奇地看着水手们把闪闪发光的铁圈套在脚脖子上。“当”的一声，脚镣戴上去了，两个受骗的土著人唔唔呶呶乱叫，在地上翻来滚去，呼唤神灵前来援救。可是叫天天不应，叫地地不灵，两个无力自卫的巨人，像两头被击昏的公牛，被拖上了大船。这些“文化传播者”背信弃义的突然袭击土著人，使他们对水手们望而生畏。
严冬寒冷的风暴刚刚过去，麦哲伦已打算继续向前航行了。于是，派忠实可靠的好友谢兰船长指挥的最小最快的“圣地亚哥”号去侦察。谢兰奉命向南航行，探查所有海湾。“圣地亚哥”号已出航不少日子了，但杳无音信，麦哲伦开始焦急起来。一天，从海岸的山坡上，远远地走来两个奇怪的人，他们赤身裸体，饥寒交迫，疲惫不堪，好似野人一样。海员们起初以为是巴塔哥尼亚人，但他们却用西班牙语喊话，后来仔细一看，原来是“圣地亚哥”号的两名水手。
两名水手带回来使人难过的信息：当“圣地亚哥”号驶入圣克鲁斯河后，遇上了风暴，船被刮到岸上，撞得粉碎。除一人牺牲以外，全船人员都有惊无险，这些人正在圣克鲁斯河口等待救援。从出事那天起到这天为止，已经8天了，他们吃的全是草根树皮，饥饿威胁着所有人的生命！
麦哲伦听完两位水手的哭诉，当即派出小船，去圣克鲁斯河口救援遇难的船员。
1520年8月24日，正是当地早春的时候，船队离开了圣胡利安湾，此时此刻，上将麦哲伦的心情十分难过，在这里整整度过了一年的时光，一艘最适于侦察的小快艇撞碎了，3个船长断送了性命，一事无成，什么也没有发现……麦哲伦暗暗地诅咒着，一股辛酸涌上心头，他冷冷地看了一眼留在岸上的两个叛乱分子，便回到旗舰的休息室，静静地坐在办公桌前沉思着。
舰队驶往何方呢？实在有些茫然。麦哲伦想：如果可能的话，将沿巴塔哥尼亚海岸前进，直到南纬25°。如果还是找不到通向南海的海峡，就选择通常的航线，经过好望角回国。这是麦哲伦第一次给自己留下后路，第一次承认海峡可能找不到。
船队航行两天之后，又停下来了，它们留在谢兰船长发现的圣克鲁斯河口附近。麦哲伦命令：船队就地进行两个月的冬眠。
