汤姆向肖传武说道：“肖传武你立刻命令部队，把太空浮雷放在“假虫洞”的周围，至于接下来如何防御你就不用担心了，我现在就去开会商议。”肖传武丧气着回答道：“嗯，总指挥，我们检查到化核人好像有一亿艘飞船和两亿战斗机，这场战争我们能赢吗？”汤姆向肖传武很很的斥责道：“肖传武！难道你没看到我们人类的实力吗？我们虽然没有一亿艘飞船，但是我们有三亿战斗机。你若敢向部队传播影响战斗力的言论，我就当场撤你的职。”肖传武说道：“总指挥说的对，我立刻命令部队布置太空浮雷。”
说完肖传武的虚影变消失了，然后汤姆在办公室徘徊，最终汤姆伸出手亮出手环，手环发出黄光照向T-200，T-200瞬间变小被汤姆收到了口袋里，然后汤姆走出办公室向会议室方向走去。太空站里人特别多，有市场和学校，看似人们一点也不担心化核人的兵临城下，但内心里的恐惧压的人喘不过气。
汤姆右脚刚刚走进会议室，会议室里的人便一起站了起来。汤姆来到桌位上向挥手让在场的各位坐下，然后说道：“化核人还有3天就来了，现在我们的部队准备的怎么样了。”反外星部队代表路·易向汤姆说道：“已经按照你的计划安排好了，就等化核人来了。”汤姆向侦查部队代表扬·萨默问道：“化核人的阵型是怎么样的。”扬·萨默向汤姆说道：“化核人的第一梯队都是运兵船，第二梯队是战斗机，第三梯队是“种子”号和各种大飞船。几乎是他们化核人全部力量了。”
汤姆说道：“我有一个大胆的想法，我们直接去把化核人的家园“种子”号占领，逼迫化核人和谈。”副总指挥方仁昌说道：“占领“种子”号不是问题，但是化核人会和我们谈判吗？”汤姆说道：“当初我被困“种子”号的时候，“种子”号里有许多革命军，我猜大部分化核人是不想发动战争的，“种子”号沦陷后革命军一定会和我们一起推翻“种子”号原有的制度。”
方仁昌说道：“我支持汤姆的计划，还有谁支持？。”在场的代表除了路·易外全部支持，路?易向汤姆说道：“地球上的人类怎么办，如果我们主力军全部去攻占“种子”号，谁来抵抗登陆在地球的化核人。”汤姆说道：“要不然这样，让75%的主力军去攻占“种子”号，其他的去守护地球，路?易你认为呢？”路?易向汤姆说道：“好吧。”汤姆向在场众人说道：“去安排吧。”汤姆说完便起身离开了。
汤姆没有回办公室，他直接来到太空站的停机场，飞行员们见到总指挥来了，于是纷纷向汤姆行礼视意。汤姆向他们说道：“化核人来了，我们该出去保卫家园了，全体成员立刻出发！”飞行员们迅速穿上太空服登上蜂群战斗机。汤姆也登上一架战斗机，与飞行员一起飞出太空站。
3亿架战斗机如蜜蜂群一样从太空站飞岀，又如一张大网一样向“假虫洞”飞去，最终3亿战斗机消失在了太空之中。
3120年5月25日一束光从“假虫洞”里冒了出来，化核人第一梯队率先冲出“假虫洞”，几千个大飞船进入视野。此飞船乃为运兵船，拥有强大的传送仪，几百万的化核人被传送到了地球，与地球上的军队开始交战。
化核人个个手拿声波枪，化核人的目的是占领地球而不是破坏，所以他们没有重武器。不过人类在声波枪面前跟本没有还手之力。运兵船渐渐陷入太空浮雷，无数的飞船开始解体，月球上的激光炮开始疯狂的照射从“假虫洞”里面涌出的飞船。化核人似乎发现了月球上的激光炮，第二梯队纷纷开始向月球进攻，两亿架狂风战机冲向月球，它们如狂风一般将激光炮化为了废墟。化核人依然没有察觉到三亿架蜂群战斗机虎视眈眈的看着他们。
渐渐的太空浮雷炸完了，月球部队也辙退了，巨大的“种子”号最终从“假虫洞”里冒了出来。汤姆通过VI广播向3亿飞行员说道：“今天我们像先祖一样来到生死悠关的局面，500年前我们人类被机器人围攻，但是我们赢了。300年前的克隆人战争我们人类依然获胜。200前的仿生人起义我们依然获胜，连刚刚过去的能源危机我们也是撑过来了，今天我们依然可以获胜。化核人不过是一群欺负弱小的懦夫，他们将害怕我们的进攻，他们化核人的“种子”号是我们的战利品，全体开机夺舰！”
化核人舰队面前突然多了一张巨网，三亿蜂群战机冲向对面“的种子”号，狂风战机如被大浪吞噬了一般，“种子”号的护卫舰纷纷解体逃窜，太空中如爆发了流星雨，无数的导弹和光柱交错纵横，人类的运兵船悄然冲进了“种子”号。
汤姆的战斗机传来警报，后面3架狂风战机盯上了汤姆的蜂群战斗机，他们不断的向汤姆射击。于是汤姆趁机飞向旁边的敌舰，敌舰看到一架蜂群战斗机便开始疯狂的射击，却击中了三架狂风战机，汤姆发出一枚导弹击中敌舰的驾驶室，敌舰瞬间瘫痪。VI：“请各单位注意了，“种子”号的一个飞机场被我方占领，立刻支援。”蜂群战斗机如找到目标一样疯狂的向“种子”号那里飞去。正在这时“种子”号开始发射激光反击，蜂群战斗机群始终无法靠近。
汤姆带领着蜂群战斗机精英，凭借着高超的闪躲本领，硬生生的窜进了占领的机场。机场里面交火不断，人类与化核人正激烈交火。化核人见到蜂群战斗机冲进机场顿时乱了起来，蜂群战斗机向地上的化核人射击，化核人四处逃窜，人类则是高声呼喊，汤姆操作蜂群战斗机降落到地上，一群士兵纷纷护送汤姆来到前线指挥部。
机场里的声音特别嘈杂，空气正飞速的向缺口中溢出，前线指挥官向汤姆说道：“长官，化核人的防御系统被我们探查到了，我们正在进攻。”汤姆说道：“你们干的真是不错，你们是人类的英雄。现在关键是攻下化核人的防御系统让大部队进来，现在组织部队配合蜂群战斗机进攻。”前线指挥官立刻转身带领士兵开始向“种子”号内部的防御系统前进。
汤姆则又登上蜂群战斗机开始清除“种子”号的激光炮台，汤姆端掉几个激光炮台后，前线指挥官通过VI说道：“长官，我们特别需要帮助……”汤姆于是来到防御系统，防御系统里的化核人特别多，还有一个力挽狂澜的巨大机甲战士。机甲战士外壳呈现金色，有5米高，背后不断的发射出跟踪导弹，机甲战士双手还握住激光炮，许多蜂群战斗机被它打了下来。
汤姆见到机甲战士心中却特别高兴，汤姆操作蜂群战斗机冲向机甲战士，机甲战士毫不犹豫的把汤姆的蜂群战斗机打爆。汤姆弹出蜂群战斗机跳到机甲战士的肩上，机甲战士试图将汤摔下的时候，汤姆的双手抱住机甲战士的头，此时汤姆双手冒起黑烟，机甲战士发出震耳欲聋的呜咽声。汤姆大吼道：“你是我的，服从与我。”机甲战士于是向肩上的汤姆说道：“圣主有什么命令？”汤姆说道：“帮我瘫痪防御系统。”机甲战士转向背后的防御系统，化核人无不吃惊和害怕，他们做梦也想不到机甲战士竟然被站在机甲战士肩上的人类控制了。
机甲战士开始进攻化核人，汤姆则命令人类士兵继续前进。很快防御系统里的化核人被打跑了，防御系统被炸的粉碎，“种子”号的激光炮台纷纷停滞，更多的蜂群战斗机和人类运兵船涌进“种子”号，“种子”号外围的化核人纷纷投降。然而在地球上化核人已经打败了人类舰队，开始在地球上进行声波轰炸，人类与化核人的战争进入到了白热化阶段。
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蜂群战斗机
FN公司在3500年生产的一款强攻系战斗机，飞机高4米，翼展10米，载弹量3吨。蜂群战斗机拥有非常强大的群体进攻系统和独立的AI系统。虽然蜂群战斗机的单挑能力特别的差，但是群体进攻能力却极强，因此蜂群战斗机特别的适用于混乱的情况下使用。
狂风战斗机
化核人的护卫型战斗机，它高5米，翼展11米，载弹量4吨。特点是防御力特别强，缺点是炮台换弹太慢，因此狂风战斗机特别适用于守卫巨大的飞船。
