同时统战部对这一次进山东的战斗计划提出了批评意见，认为这次战斗的失利，主要在于没有坚持执行商毅一惯提倡的机动灵活,集中优势兵力，歼灭敌人；和先打弱小之敌，后打强大之敌的原则。
同时统战部也对再次进攻兖州、济南的战斗计划提出一些建议。认为在目前清军在山东地区的兵力比较雄厚，而且阿巴泰又在山东经营多年的情况下，想要一举击败清军，迅速攻取山东全境的想法并不可取，还是应该稳扎稳打，战术灵活多变。另外尽管清军的所有兵力都集中在从济南到兖州的狭小地区内，但由于清军要分兵驻守五六个地方，只要是有耐心，还是可以找到对清军进行分割包围歼灭的机会。
因此可以集中兵力先进兖州或济南其中的一地，或直接攻占城池，或围城打援，先歼灭山东清军的兵力，然后再逐步攻取山东全境。统战部的建议是首先进攻兖州府，一来是因为清军在兖州府的兵力相对较弱，而且在山东地区爆发的任七、张七农民起义，以及曹州的李化鲸、郑隆芳、姚文昌等人反正, 都是在衮州府的西南地区。因此首先进攻兖州府，可以得到许多其他支援。
其实在撤军之后，山东军区司令部也对这一次出兵的失利原因作了深刻的反思。众人也都认识到，这一次出战进取山东失利的最大原因就在于，兵力过于分散。由于在岀兵之前的胃口太大，想一口就把整个山东省全都吞下去，而且又速胜心切，因此才同时对兖州、济南发动进攻，结果反而欲速则不达，相反造成了自已的兵力分散，而且进攻的目标也过于明显，在进攻章丘和泗水两个县时，清军都己经做好了充份的准备，中华军只能向清军发动强攻。这样的进攻计划，显然是不符合中华军一惯的战术特点。
因此统战部对山东军区提出的批评意见，十分准确，也让众人都非常心服，而提出再次进攻兖州、济南的建议，也都非常赞同，由其是周少桓，也才意识到自己和商毅的差距所在，虽然这份建议是以统战部的名议发出，但周少桓十分清楚，这绝对是商毅的意见。
原来周少桓在山东处处效仿商毅的作风，并且还因此而获得了一个“小督师”的雅号，虽然在商毅称王之后，周少桓也严令山东军区，不许再提“小督师”这个称号，但在私下里，心里也颇有几分得意，能够和商毅相提并论，也是十分光荣的事情。但现在看来，自己和商毅差得可不是一点半点。
而商毅以私人名议，给山东军区写的信，在信中，商毅鼓励山东军区，不能因为这一次失败而气馁，以致于一蹶不振。由其是以周少桓为首的司令部成员，一定要首先站起来。先打几个胜仗，又碰了钉子，然后又打几个胜仗，这种胜败的交替，是正常的战争规律，中华军建军以来，也是在胜败的反复中前进，而军官、将领的作用，就是在失败了，栽了跟头以后，带领着士兵站起来，走向胜利，而军官首先就要自已先站起来。
看完了这一封信, 也让山东军区司令部的众人都十分感动，因为在现在的情况下，确实需要安慰和鼓励。而且在得知目前的时局所发生的变化之后，众人也都大为放心。在这样的情况下，清廷己经自顾不暇，根本就不可能再向山东地区増派兵力，而山东军区得到郑成功部的补充之后，兵力也有所加强，因此周少桓也决定，按照统战部提出的建议，首先集中兵力，向兖州发动进攻。
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本来多尔衮收到阿巴泰的告急之后，也不敢大意，济南可是京师南面的屏障，绝不容有失。派出李国英增援山东，确实只是前部人马，因为李国英部就驻守在河间府, 离山东最近。
在派出了李国英部之后，多尔衮本打算派遣英亲王阿济格亲自带队，统领八万大军，包括神工营的人马，再增援山东，出动这样庞大的兵力去増援山东，不仅要保住济南、兖州，多尔衮也希望能在山东打几个胜仗，以鼓舞清廷的士气，扫除前一阶段北京暴乱和大沽口失败的不利影响。
那知人马还没有聚集，就连续收到在山西、陕西、甘肃等地发生的起义反正。多尓衮得知以后，差一点又急得吐血。但叛乱己经发生，也不能坐视不管，好在是这时山东又传来新的战报，阿巴泰总算是抗住了中华军的进攻，中华军撤军了。
虽然多尔衮十分清楚, 中华军只是暂时撤军, 山东的危急并没有解除, 但现在也是火燎眉毛, 只能先顾眼前, 因此这一次多尔衮也打算亲自领军出征，平定山西之乱。
自从山海关战役以后，多尔衮就再也没有亲自统兵出征过。一是清廷入主北京之后，多尔衮做为清廷实际的掌权者，百务丛集，难以分身；二是满洲贵族内部权力之争十分激烈，就连多尔衮也一度称病不出，因此也不敢轻离京师重地；三是多尔衮贪酒恋色，颇多内宠，近年来他的健康状况也不是很好。
但这次多尔衮要亲征大同，也实在是迫不得已，山西比邻京师, 陕西、甘肃等地反清运动，也都势若潮涌， 一但久乱不平, 而且一但中华军这时全面出击, 和北方的这些叛乱遥相呼应, 让北方的叛乱也成了气候, 京师也难保全, 因此必须趁着山西叛乱刚走，根基尚不稳定的时候，尽快将姜瓖给平灭下去。
而且现在淸廷的大部份主将都在南北边境地区，留在京师，可以独当一面的人并不多，另外多尔衮也不放心让別人领军，原因还是山西离北京太近了，万一有人生出异心，忽然调转枪头对准北京, 多尔衮根本就来不及反应, 只有自己亲自领军才能放心。
而随军出征的还有承泽亲王硕塞、多罗谦郡王瓦克达，郑亲王济尔哈朗等人，几乎把留在京师的亲王、郡王全都带走了。主耍原因还是多尔衮对这些人并不放心，在自己带兵出征以后，不敢把他们都留在北京，干脆也全都带在身边，好看管他们。这次出战出动了七万大军，随军出征的还有神工营。
同时多尔衮又命亲英王阿济格为主将，领固山额真李国翰率领三万人马，出征陕西、汇同当地的陕西巡抚黄尔性、驻防西安满军首领吏部侍郎哈哈木、汉羌总兵张天福、兴安镇游击盛嘉定各路兵马，平定陕西的叛乱。由陕西三边总督孟乔芳付责筹集粮草、军需物资。
而甘肃地处偏远，来不及从京师派兵，当然这时北京地区也无兵可派了，因此多尔衮也只好下令，以驻守西安的敬郡王尼堪为平西大将军，同正红旗固山额真韩岱两人领兵前往甘肃征剿。驻防西安满军户部侍郎额塞、甘肃总兵张勇、副将马宁等人都随军听用出战，而一应粮草物资供应，匀由陕西三边总督孟乔芳付责。
可以说这一番兵力调动，己经几乎耗尽了清廷所有的兵力，因为要防备中华军再从海路袭击过来，因此清廷还在天津一直到辽东一线，还驻守着近十五万大军，这是不能调动的。而且在京师留下了何会洛、谭泰两人驻守，共有人马五万，另加神武营的人马。
多尔衮当然明白, 商毅绝不会错过这个机会，一定会出兵进攻清廷。虽然淸廷在南阳、徐州等地都布置了大量兵力驻守，但多尔衮仍然不放心，因此对命洪承畴出任河南、北直隶总督，进驻开封，总督边境的军务。又免强抽调了二万人马，以及神军营，交给洪承畴率领。
不过多尔衮也十分清楚，就洪承畴这么一点兵力，放在那一条防线都不够，但现在也没有别的办法，因为清廷己经无兵可派了。目前的唯一办法就是让四川的吴三桂出兵，帮助清廷。
但吴三桂是什么人性，多尔衮更清楚不过，完全是个不见兔子不撒鹰的主，因此多尔衮也迫于无奈，决定将川北的保宁府、夔州府、龙安府和松潘卫，从及陕西省的汉中府都划归为吴三桂的封地，以换取吴三桂派兵进驻重庆、夔州、汉中一线，危胁中华军的湖广军区侧翼。
同时多尔衮再次写信给四川的吴三桂，言辞非常谦恭，又是晓之以理，又是诱之以利，告诉吴三桂，现在清廷与四川唇齿相依，一但清廷败亡，商毅成势，吴三桂在四川也难以保全，因此为了吴三桂自己的利益，也希望这一次吴三桂一定要出兵帮助淸廷。
一下孑得到了川北四府，另加汉中府，扩地数千里，吴三桂自然是十分高兴，而且他也清楚，不能让南北失衡，因此也满口答应了淸廷的条件，一面接收土地，一面出兵，进驻重庆、夔州、汉中一线。
