乾隆帝是有作为的皇帝，在他执政期间，各民族间和睦团结，但仍有一些地方发生****，威胁清政府的统治。
乾隆五十一年（公元1788年），台湾天地会数千人在林爽文、庄大田的领导下，其人数越来越多，攻城夺县严重威胁着清朝的统治。台湾总兵柴大化一面坚守，拼命抵抗；一面上奏朝廷、请求派兵协助剿灭天地会。乾隆帝得知后，一面嘉奖柴大化等固守有功的将士，一面派镇远大将军福康安率兵援台。
沙场宿将福康安善于用兵，而部下海兰察又是其得力战将。二人经过周密研究，制定一个声东击西的作战计划。在佯攻天地会的根据地大理杙庄的同时派精锐兵将偃旗息鼓，直奔被天地会包围的嘉义县。林爽文中其计，分兵回救大理杙庄。结果被福康安逐一击败，林爽文、庄大田被杀。台湾天地会剿灭后，乾隆帝命福康安为两广总督，坐镇广东，封海兰察为超勇公。乾隆五十六年（1791年）廓尔喀入侵西藏，乾隆又命二人前去攻打廓尔喀军。
廓尔喀部落大约在18世纪中期兴起，于现今尼泊尔境内，建立了一个野心勃勃的王朝。曾在乾隆五十三年（公元1788年）强占聂拉木，朝廷派巴忠前去交涉，要求归还聂拉木，而巴忠竟擅自答应每年给廓尔喀交纳白银近一万两，这样才把聂拉木救回。事后又隐瞒此事，此后廓尔喀每年都派人向西藏索要此款。而西藏****与****对此事根本不知道，为此廓尔喀大怒，准备派兵入侵西藏，要求赔偿这几年的银子。
乾隆四十五年六世****进京为乾隆祝寿，不幸死在承德，其兄仲巴呼图克图与其弟红帽喇嘛沙马尔巴一向不合，而其兄仲巴呼图克图护送****遗体回西藏时又把乾隆赐给****作为殡葬用的金银珠宝全部占为己有，更引起其弟沙马尔巴的不满，沙马尔巴不顾国家与民族利益，投靠廓尔喀，并唆使权臣巴都尔沙入侵西藏，以求达到个人的目的。于是巴都尔沙在乾隆五十六年二次入侵西藏，乾隆得知此事，立即追问巴忠，巴忠畏罪自杀。乾隆帝了解清楚情况后立即调两广总督福康安为将，超勇公海兰察为参赞，率大军入藏征讨廓尔喀军。
廓尔喀军得知清军大队人马前来支援十分恐慌，抢掠后大队人马匆匆逃回本国。福康安命海兰察率军继续追剿，海兰察乘廓尔喀军不备，越过一条狭窄的险路，直攻敌营打得敌人措手不及，狼狈逃窜，很快将敌人全部赶回廓尔喀境内。
廓尔喀权臣巴都尔沙回本国后，立即下令拆掉铁索桥，认为有此天险，清军是不会过河的，海兰察一面命部分骑兵沿河扎营以稳军心。命令另一部分士兵，乘黑夜绕至上游，伐木作筏偷渡过河，当廓尔喀军发现清军时，已来不及抵抗了，只得纷纷溃退下去，海兰察挥军直下，连克廓尔喀数城，迫使廓尔喀拉特纳巴都尔派使臣，向福康安投降，表示再不敢冒犯天威。
福康安郑重地说：“你们如真心求和，第一把掠夺扎什伦布寺的财物全部交还。第二将祸首沙马尔巴交出。第三今后每五年向天朝进贡特产一次。”使臣一一接受。并于第二天又送来牛、猪、羊各百头，米二百石以及果品、糖茶、酒等犒劳清军。
福康安接受廓尔喀交来的降表后，撤兵转回西藏，受到八世****和七世****的热烈欢迎，大犒三军庆贺胜利。福康安与****、****共同商议制定了一个《西藏善后章程》，就班师回朝了。
乾隆帝对廓尔喀外邦的入侵西藏，坚决给予还击，表明了清政府对西藏问题的正确立场。西藏历来是中国领土必不可少的一部分，不容异邦随意入侵或诋毁。福康安率军彻底征服廓尔喀，维护了西藏主权，其功绩昭示后人。
