第一节 文物外运与南迁
清代民国之交，沈阳故宫受到最大影响而且发生重要变化的就是收藏于此处的宫廷文物。清末民初之际，国运衰微，政治腐败，盛京皇宫的各类珍藏品也常有丢失损坏现象。但由于宫殿禁地身处内城中心，又有内务府和清宫善后人员各司其职，宫内大多藏品总体来说尚能保持完整。
1911年辛亥革命推翻了清王朝统治，奉天（盛京）宫殿的一大批国宝便失去了受到保护的最后屏障。1914年，北洋政府内务总长朱启钤呈文经大总统袁世凯批准，决定于北京故宫“外朝”（乾清门以南，主要是三大殿）建立“古物陈列所”，归属内务部（后称内政部）领导。因当时北京故宫内大部分物品尚属于留居内廷的逊清皇室，遂议定将奉天故宫和热河行宫（承德避暑山庄）所藏清代宫廷物品运至北京，以敷陈列之用。
是年三月，奉天宫殿所珍藏的十一万五千一百九十九件藏品运抵北京，连同热河行宫运至者共各种文物二十余万件。同年十月，从中选择部分精品于文华殿、武英殿、太和殿、中和殿、保和殿内陈列就绪，公开展览。翌年，奉天故宫文溯阁所藏枟四库全书枠和枟钦定古今图书集成枠亦被运至北京，置于保和殿等处，仍归古物陈列所。
1931年“九一八”事变后，平津局势趋于紧张，相关人士经过精心策划，将北京故宫博物院并古物陈列所的绝大多数古物装箱南迁，当时，在京的十一万余件奉天故宫藏品亦被分作四批一同运往上海、南京。1937年“抗日战争”爆发后，这批国宝又辗转移往四川等地；1945年抗战胜利之后，它们又辗转运回南京。
1949年中华人民共和国成立前夕，国民党当局将南迁古物当中的精品运往台湾，剩余部分在解放后有的陆续运回北京故宫，有的则留存南京博物院等处。总之，运往“古物陈列所”的十余万件奉天故宫文物，除文溯阁枟四库全书枠于1925年运回外，其余绝大多数文物至今散存于台北故宫博物院、北京故宫博物院和南京博物院等处，只有极少数原藏品通过北京故宫的回拨渠道，得以回到沈阳故宫。
民国初年的这次文物外运，无疑是沈阳故宫的一场“浩劫”，原藏于沈阳故宫飞龙阁、翔凤阁和东七间楼的各类宫廷陈设品、御用珍宝、宋元明清书画、古铜鼎彝、御用武备及明清瓷器等几乎被拨运一空，西七间楼内所藏殿版图书也有一部分被同时运走。自清朝中叶以来，素以贮藏宫廷文物丰富著称的盛京皇宫，其珍藏国宝丧失殆尽，所余大宗者仅有敬典阁、崇谟阁二楼内的枟玉牒枠、枟实录枠、枟圣训枠等物，其他尚存者，也只有西七间楼的部分书籍、墨刻、档案，清宁宫内的萨满祭器，銮驾库内卤簿、仪仗、乐器，太庙的玉宝、玉册，以及日华楼、师善斋所储门神、对联等杂物，西七间楼的数百面信牌、印牌等物，这样，除了文溯阁枟四库全书枠和西七间楼各种内府写本、刻本书籍外，较有价值的文物藏品总共不过千余件，真可谓“锱铢累积，一朝散尽”。
1926年，在有关人士积极奔走和各级政府支持下，在沈阳故宫宫殿旧址上成立了“东三省博物馆”，此后，博物馆陆续开展文物藏品征集与对外展览等项工作，事业有所发展。1927年，文溯阁枟四库全书枠在东北人士积极呼吁下被运回沈阳故宫，重入文溯阁存放。
1931年“九一八”事变后，东北三省博物馆被迫关闭。1932年，伪奉天省政府在原博物馆基础上建立“奉天故宫博物馆”，但对外征集和展览工作并没有更大进展。1936年，故宫博物馆关闭，所有文物藏品转归伪“奉天国立博物馆”所有。
1947年，民国政府拟于沈阳成立“国立沈阳博物院”，沈阳故宫成为其分支机构，设立为“古物馆”，并积极开展对外展览活动。1948年4月份起，由于东北时局紧张，民国政府着手将沈阳博物院古物、图书两馆所藏珍贵文物启运北平，至6月初，已分三批将盛京太庙的玉宝、玉册，图书馆所藏书籍和精品辽瓷等先后运往北平；同年9月，“沈阳博物院”以赴紫禁城午门举办“东北文物展览会”名义又将一批瓷器、铜镜、档案和殿版书籍等共重3吨的文物和史料空运北平，这批文物直至北平和平解放后，才连同其他在京文物一起运返沈阳。
第二节 枟四库全书枠回归
1915年初，奉天（沈阳）故宫文溯阁内所藏枟四库全书枠和枟古今图书集成枠等重要文物，因北京故宫外朝古物陈列所展览之用，被北洋政府调往北平，放置于北京故宫保和殿等处，归古物陈列所保管和展览。
1925年，奉天省（今辽宁省）教育会会长冯广民等人赴北平参加“清室善后会议”，他们在参观古物陈列所时，于保和殿内看到作为陈列品的部分文溯阁枟四库全书枠。当时，正值奉系军阀在第二次直奉战争中获胜，北平政局处于奉系控制之下，冯广民等人便乘机欲将全书运回。他们先赴天津求助于张学良、杨宇霆，又回北平访问相关人士求得支持，最后经过内阁会议通过，允许将全书运回。
是年8月，冯广民等邀集旅京的奉天省人士三十余人，用8天时间将全书检收包装，于8月7日将三万六千余册枟四库全书枠和五千余册枟古今图书集成枠全部运回沈阳，暂存于省教育会所属文庙内，此事在当时被视为东三省文化界的一大喜事，省教育会还特别组建了“文溯阁枟四库全书枠保管委员会”。1926 年 6 月至 9月，省政府拨专款对文溯阁内外建筑加以整修。
1927年初，在异地他乡漂泊了十余年的文溯阁枟四库全书枠终于完璧归赵，回归沈阳故宫文溯阁的怀抱，实现了“书阁合一”的美好梦想。1931年6月，省教育会特意镌刻一方枟文溯阁枙四库全书枛运复记枠砖碑，将其镶嵌于文溯阁外东面墙壁上，以纪念这一宝藏的回归。
1935年，日伪统治期间，伪“国立奉天图书馆”以文溯阁多年失修及保护阁内藏书为由，在文溯阁前西南处修建了一座二层楼书库，其建筑为钢筋水泥结构，门窗皆包以铁皮，库内放置钢制组合书架；1937年夏，文溯阁原藏枟四库全书枠和枟古今图书集成枠被全部移入新库房。
1948年6月，民国政府将文溯阁枟四库全书枠运至北京故宫。1949年4月北平解放后，东北人民政府又将枟四库全书枠运回沈阳。中华人民共和国成立后，文溯阁及枟四库全书枠作为国家珍贵文物受到特殊保护。
1950年“抗美援朝战争”爆发。翌年，因沈阳距离朝鲜战场较近，政府部门将沈阳故宫内枟四库全书枠等重要文物运往黑龙江北安保管。1954年朝鲜战争停战后，这批文物复运回沈阳故宫保管。
1965年8月，中苏外交关系趋于紧张，鉴于当时备战形势需要，为确保文溯阁枟四库全书枠的安全，中央及省市政府决定将沈阳故宫文溯阁枟四库全书枠外移暂存。1966年10月，文溯阁枟四库全书枠被拨运甘肃省图书馆收藏，后运至永登县专库收藏保管，从此，文溯阁枟四库全书枠与原阁分离，造成国宝与收藏地天各一方的巨大遗憾。
第三节 博物馆馆藏文物
1948年末，沈阳解放，沈阳故宫回到人民的手中，翌年，经东北人民政府批准，正式成立了“故宫陈列所”，并正式对外进行文物征集与公开展览工作。
1954年，沈阳故宫被国家确定为清代历史、艺术性质的博物馆，1955年正式定名为“沈阳故宫博物馆”。1986年，改称沈阳故宫博物院。此后，通过政府调拨、自身征集、社会捐献等多种途径，沈阳故宫的藏品由解放初期的几千件，增加到现在的数万件，而且院藏品当中的清入关前宫廷历史遗物、清代官窑瓷器、明清书法绘画、清宫御用文物、清宫艺术品、清宫服饰、清代武备、清代家具、清宫金银珠宝等品种均在国内博物馆居于上乘水平，丰富而精美的文物藏品为沈阳故宫博物馆陈列工作、学术研究提供了坚实的基础，使沈阳故宫成为以宫殿建筑和清宫文物收藏著称的著名博物馆。
沈阳故宫博物院现藏文物基本有如下几个来源：
其一，20世纪50~80年代，由北京故宫调拨和对换的清代宫廷文物、书画、瓷器、雕刻、玉器、漆器、织绣品、钟表、家具、陈设、杂项、武备等项，由上海博物馆、上海文管会、南京博物院、陕西博物馆等文博单位调拨的书画艺术品和瓷器、铜器、陶器等项；
其二，20世纪六七十年代，在沈阳市政府大力支持下，特别是60年代初由市政府出资30万元，由我院文物征集人员到北京、上海等地大批量购入明清绘画书法艺术品和瓷器品；
其三，20世纪20年代建馆以来，从各地征集、考古发掘、私人捐献而入藏的明清书画艺术品、清代瓷器、雕刻品、织绣品、金银珠宝、碑刻和其他古代文物等；
其四，我院文物保管人员对院藏文物、文物资料和其他无账院藏品的整理、修复，增加了院藏文物的数量。
现在，沈阳故宫博物院所收藏的各类文物藏品，基本按照文物的材质与使用属性进行划分，共计分为23项，分别为：瓷器、雕刻品、漆器、织绣品、绘画、书法、金银珠宝、玻璃器、家具、陈设品、乐器、珐琅器、考古、碑志、金属器、杂项、宫廷遗物、武器、现代工艺、革命文物、民俗、钱币、古建附件等项，其中许多文物珍品都以其独一无二的珍贵历史性或精美艺术性，在全国文博界享有盛誉，成为举世公认的国宝珍品。
